Чем подчищаете - вручную или программно?
Если есть возможность загрузиться с cd-WinPE или аналогичной оболочки на флешке, можно почистить (как правило скрытые) каталоги в папках пользователей, куда винда скидывает всю временную чепуху и от этого "толстеет" - там как правило многие гигабайты всякого барахла валяются ...